Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms