Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT1P21579 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms