Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD53P19397 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD53P19397 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD53P19397 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD53P19397 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD53P19397 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms