Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms