Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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