Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETFAP13804 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETFAP13804 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETFAP13804 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms