Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCG2P13521 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCG2P13521 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCG2P13521 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG2P13521 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCG2P13521 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCG2P13521 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCG2P13521 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCG2P13521 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCG2P13521 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG2P13521 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG2P13521 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG2P13521 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG2P13521 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG2P13521 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG2P13521 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG2P13521 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG2P13521 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG2P13521 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG2P13521 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG2P13521 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG2P13521 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG2P13521 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG2P13521 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG2P13521 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG2P13521 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG2P13521 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms