Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms