Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms