Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms