Protein–RNA interactions for Protein: P09228

CST2, Cystatin-SA, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST2P09228 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST2P09228 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST2P09228 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST2P09228 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST2P09228 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST2P09228 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST2P09228 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST2P09228 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST2P09228 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CST2P09228 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST2P09228 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST2P09228 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST2P09228 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST2P09228 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST2P09228 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST2P09228 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CST2P09228 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST2P09228 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST2P09228 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST2P09228 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST2P09228 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST2P09228 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST2P09228 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms