Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms