Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms