Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX7O95931 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX7O95931 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX7O95931 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX7O95931 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX7O95931 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX7O95931 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX7O95931 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms