Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT4O95628 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms