Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAPGEF3O95398 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAPGEF3O95398 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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