Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALX3O95076 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALX3O95076 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALX3O95076 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALX3O95076 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALX3O95076 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALX3O95076 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALX3O95076 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALX3O95076 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALX3O95076 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALX3O95076 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALX3O95076 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALX3O95076 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALX3O95076 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALX3O95076 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALX3O95076 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALX3O95076 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALX3O95076 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALX3O95076 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms