Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP2O95045 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP2O95045 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP2O95045 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP2O95045 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP2O95045 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP2O95045 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP2O95045 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP2O95045 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP2O95045 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP2O95045 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP2O95045 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP2O95045 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP2O95045 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP2O95045 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP2O95045 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP2O95045 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP2O95045 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP2O95045 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP2O95045 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP2O95045 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP2O95045 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP2O95045 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP2O95045 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms