Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms