Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKAP2O75563 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms