Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP104O60308 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP104O60308 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP104O60308 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP104O60308 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP104O60308 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CEP104O60308 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CEP104O60308 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CEP104O60308 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CEP104O60308 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CEP104O60308 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP104O60308 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms