Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms