Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms