Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNQ3O43525 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms