Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms