Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNPHO15079 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNPHO15079 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNPHO15079 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms