Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms