Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms