Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms