Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms