Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DGG1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DGG1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DGG1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DGG1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DGG1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DGG1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DGG1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DGG1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DGG1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DGG1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DGG1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DGG1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms