Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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LINC00587B1AMM8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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