Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACOD1A6NK06 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms