Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms