Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSDA5PKW4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms