Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
EFCAB5A4FU69 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFCAB5A4FU69 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms