Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms