Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP3Q9Y6F1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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