Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms