Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms