Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ICE1Q9Y2F5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms