Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS3Q9UPU3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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