Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms