Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM44

HHLA2, HERV-H LTR-associating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA2Q9UM44 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms