Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MID2Q9UJV3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms