Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF11Q9UIL8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF11Q9UIL8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms