Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms