Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms