Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APEX2Q9UBZ4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms