Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms